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如何用Gaussian看波函數

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Gaussian可以拿來觀看分子的波函數,可以選擇要看的是LUMO,HOMO,或是總電子雲密度。 1.     創建分子團 首先,用GaussView創建新的分子團,角度跟方向先不用刻意處理,只要分子相對位置及鍵結差不多即可! 此處以乙酸為例 2.     ctrl+s存檔,並以記事本打開此檔案,即可檢視 。 圖中會顯示chk檔位置,使用方法,電荷,多重度,座標,鍵結級數 3.     回到GaussView視窗,點擊Gaussian calculation setup(快捷ctrl+G) 4.      選取能量,然後點選submit,後面參數先不用調整 5.     等待G09計算,直到執行完成,即可先關閉G09, 此視窗請點選.chk,不然看不到波函數 計算完成的分子,乍看下是一樣的,但是上面附檔名會是.chk 6.     回到GaussView視窗,點選Result>Surfaces/Contours 在此畫面中,選取New Cube 這裡可以選取顯示的有,MO、電子雲密度 在MO中,可以選取LUMO、HOMO,或是一次選取 生成後,選取Cube,再點選New Surface,就可以看到選定的MO了 乙酸HOMO 乙酸LUMO 要看總電子密度也是可以的 選取Mapped Surface可以看到密度分布 選取只顯示表層,然後選ESP 表層電子雲密度分布就出現了 選取Hide,可以隱藏掉不要顯示的部分喔! 回到GaussView,選取Save image file或是Windows+S,就能保存當前2D畫面囉! 那要怎麼保存3D圖呢?那請把chk檔給想要看的人吧! 注意!此分子的波函數不會是現實中分子的波函數,因為他可能結構有異,或是因為在現實中他是在水溶液環境中,(Gaussian預設為在真空中氣體分子的互動)。 那該如何調整或優化結構,或是調整環境呢?請待後續文章揭曉。 若是您正在研究量子化學或是有興趣的話,歡迎繼續點閱後續的文章。 敬請不吝指教!! 參考: 1.Gaussian官網: http://gaussian.com/ 2.成大化學系 鄭沐政老師 - 分子與材料模擬技術課程

如何使用ImageJ分析金相圖相分率

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材料學中,判斷金相圖是所有材料人必經的過程。但是,一樣的晶相,每個人說的結論都不太相同,所以同樣一張照片,用電腦判斷金相圖有其必要性。 本次,路谷兮將以ImageJ作為操作軟體,並以錫鉛合金作為範例,教你如何判斷相分率。 第一步:開啟ImageJ,並載入金相圖 第二步:調整圖片成8-bit 第三步:點擊Threshold 此時,畫面會長的像這樣,若是前面未調整金相圖Type,將會分析不了照片強度。 此處可以調整要選取的值上下限、顯示顏色。 此處以預設為例。 第四步:點擊分析粒子數 此時會跳出此視窗,此處已預設為例。 第五步:分析完成,Summary中的%Area就是相分率 因為此處以錫鉛合金為例,觀察原金相圖,可以得知原本白色,現在是紅色被選取的部分是Beta相。雖然說本次分析的是截面下的相分率,但是我們假設整個材料是均勻的,所以可以將此值當作體積分率。若是要精準量測相分率,請用其他軟體測量。 若是您正在對ImageJ有興趣的話,歡迎繼續點閱後續的文章。 敬請不吝指教!! 感謝成大材料系材料實驗課-顏紹宇助教的指導。

如何將csv/txt檔轉換為excel檔

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儀器數據輸出後的檔案常常是csv檔,或是txt檔,顯示數據上醜,而且沒辦法做圖表分析。 剛好路谷兮在上課時,發現同學們似乎不知道這個功能,所以我覺得做一篇文章,幫助正在處理實驗數據的你。 那該如何轉檔呢? 第一步:開啟excel,點選上方資料(Data)按鍵 第二步:點擊左上角,有個From Text/CSV 第三步:尋找檔案位置,並匯入檔案 第四步:選取要分隔的符號,此處以分號(Semicolon)為例 第四步:點擊下方的load 第五步:數據匯入成功!! 若是您正在學習使用excel的話,歡迎繼續點閱後續的文章。 敬請不吝指教!! 感謝成大材料系材料實驗課-蔡依芸助教提供機會讓我分享。