如何用Gaussian看波函數

Gaussian可以拿來觀看分子的波函數,可以選擇要看的是LUMO,HOMO,或是總電子雲密度。

1.    創建分子團
首先,用GaussView創建新的分子團,角度跟方向先不用刻意處理,只要分子相對位置及鍵結差不多即可!
此處以乙酸為例

2.    ctrl+s存檔,並以記事本打開此檔案,即可檢視
圖中會顯示chk檔位置,使用方法,電荷,多重度,座標,鍵結級數

3.    回到GaussView視窗,點擊Gaussian calculation setup(快捷ctrl+G)

4.    選取能量,然後點選submit,後面參數先不用調整

5.    等待G09計算,直到執行完成,即可先關閉G09,
此視窗請點選.chk,不然看不到波函數
計算完成的分子,乍看下是一樣的,但是上面附檔名會是.chk

6.    回到GaussView視窗,點選Result>Surfaces/Contours

在此畫面中,選取New Cube

這裡可以選取顯示的有,MO、電子雲密度

在MO中,可以選取LUMO、HOMO,或是一次選取

生成後,選取Cube,再點選New Surface,就可以看到選定的MO了

乙酸HOMO

乙酸LUMO

要看總電子密度也是可以的

選取Mapped Surface可以看到密度分布

選取只顯示表層,然後選ESP

表層電子雲密度分布就出現了

選取Hide,可以隱藏掉不要顯示的部分喔!

回到GaussView,選取Save image file或是Windows+S,就能保存當前2D畫面囉!

那要怎麼保存3D圖呢?那請把chk檔給想要看的人吧!

注意!此分子的波函數不會是現實中分子的波函數,因為他可能結構有異,或是因為在現實中他是在水溶液環境中,(Gaussian預設為在真空中氣體分子的互動)。
那該如何調整或優化結構,或是調整環境呢?請待後續文章揭曉。

若是您正在研究量子化學或是有興趣的話,歡迎繼續點閱後續的文章。
敬請不吝指教!!


參考:
1.Gaussian官網:
2.成大化學系鄭沐政老師-分子與材料模擬技術課程

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